Un poquito más de información nos vendría bien. ¿Cómo es tu hardware? ¿Cómo instalaste la imagen al HDD? ¿Cómo tienes configurado tu boot en el BIOS?
FreeNAS no está hecho para ser instalado en un disco duro, debes de bajarlo a una memoria USB y correrlo desde ahí, FreeNAS después corre en modo de sólo lectura para minimizar la escritura a la USB y no se deteriore rápidamente. Si sí lo instalas en un disco duro, no podrás usar el espacio restante para guardar información.