Zunächst nochmal, die mDNS Fehlermeldung ist nicht relevant und verursacht auch keinerlei Probleme.
Bzgl. der 64-bit Version: In einem der ersten Antworten hast du noch erwähnt, dass 4 GB RAM verbaut sind? Mit nur 2 GB RAM musst du einige Sachen beachten, z.b. dass du ausschließlich UFS nutzen solltest, denn mit ZFS droht Datenverlust und ein generell instabiles System. Auch Plugins werden nicht mehr drin sein. Von daher, wenn du ZFS nutzt solltest du RAM aufrüsten oder auf UFS wechseln.
Generell ist eine Diagnose momentan noch recht schwer. Es gibt verschiedene Möglichkeiten: Der Mangel an RAM könnte auch deine anderen Probleme erklären. Also zweite Problemursache kommt fehlerhafter RAM in Frage, um das auzuschließen solltest du das Tool memtest86+ mal durchlaufen lassen. Gibt es z.b. auf der
Ultimate Boot CD. Hier werden drei Durchläufe empfohlen, um fehlerhaften RAM ausschließen zu können (dauert idR mehrere Stunden).
Eine dritte Ursache könnten Fehler der Festplatte sein. Um das zu prüfen, solltest du mal die SMART Attribute prüfen. Diese lassen sich mit
smartctl -a /dev/adaX abrufen, X durch Nummer der Festplatte ersetzen. Sollte 0 oder 1 sein bei deinem Setup. Interessant Werte sind hier oft Offline Sectors, Unavailable Sectors, Read und Multizone Errors. Zusätzlich kann ein SMART Test Aufschluss über die Gesundheit der Festplatte geben. Diese kann man via Freenas GUI durchführen (siehe Anleitung) oder über die command line. z.b. für einen kurzen Test mit
smartctl -t short /dev/adaX. Die Ergebnisse lassen sich dann wenige Minuten (Kurztest) oder Stunden (Langer Test) später mit
smartctl -a /dev/adaX abrufen (ganz unten).
Wenn du ZFS nutzt, sollte das System regelmäßig Scrubs ausführen, welche die Datenintegrität verifizieren. Die Ergebnise werden dir in der GUI mitgeteilt unter Volume Status (und die Lampe sollte gelb oder rot werden, wenn es Probleme gibt). Alternativ lassen sich auch diese Ergebnisse via CLI abrufen mit
zpool status.
Mit Clonezilla kenne ich mich nicht aus, aber wieso nutzt es CIFS (weil da CIFS Fehlermeldungen auftauchen)? Wenn du eine Festplatte klonen willst, sollte das optimalerweise lokal erfolgen und nicht über Netzwerk. Clonezilla sollte das auch lokal hinkriegen, ansonsten geht es auch mit dem bei FreeNAS mitgelieferten Tool
dd.
Das war jetzt viele Informationen, aber es kann gut sein dass deine Hardware nicht stark genug ist (besonders die Menge an RAM), oder irgendwo fehlerhaft arbeitet. Wenn dann solche Symptome wie von dir beschrieben auftreten, ist es leider oft schon zu spät; besonders wenn wie bei dir keinerlei Redundanz der Daten gegeben ist und anscheinend auch keine regelmäßigen Tests gelaufen sind.
D.h. der Schritt die Festplatte zu klonen ist erstmal eine gute Idee, um zumindest nichts mehr zu verschlimmern. Dies würde ich unbedingt lokal machen, evtl. auch komplett an einem anderen PC (Festplatte umbauen); aber auf keinen Fall übers Netzwerk. Danach dann schrittweise die Hardware testen (mit einem RAM-Test anfangen). Wenn alles OK ist, RAM aufrüsten und die 64 Bit Version nutzen, eine zweite Festplatte zur Redundanz einrichten und auf ZFS setzen (z.b. als Mirror).